日本コンピュータ化学会2024秋季年会にて石郷岡さん(M1)が発表した研究内容が、精選論文に選出され、Journal of Computer Chemistry, Japanに掲載されました。

有効フラグメントポテンシャル法に基づく分子動力学シミュレーションにより、凍結保護剤として活用されるDMSOの水和構造を、溶質溶媒間相互作用の観点から検討しました。

Journal of Computer Chemistry, Japan

ジメチルスルホキシドの水和構造評価: 有効フラグメントポテンシャル-分子動力学計算

石郷岡 知里, 黒木 菜保子*
J. Comput. Chem. Jpn. 24, 1, 1–4 (2025.3.14).
DOI: 10.2477/jccj.2024-0042

Dimethyl sulfoxide (DMSO), widely used as a cryoprotectant, drug, and oxidant, contains a hydrophilic S=O and hydrophobic CH₃ groups and is fully miscible with water in any ratio. In this study, intermolecular interactions in dilute aqueous DMSO solution were analyzed using effective fragment potential-molecular dynamics (EFP-MD) simulations. The analysis revealed that DMSO induced stable interactions with water molecules not only around its hydrophilic S=O group but also near the CH₃ groups. The interaction lifetimes suggested that the hydrogen bonding network in the first hydration shell is directional.